一篇涵蓋失眠、阻塞性睡眠呼吸中止（OSA）及快速動眼期睡眠行為障礙（RBD）的系統性回顧與統合分析發現，睡眠障礙患者的腸道菌相多樣性顯著降低，且三種疾患呈現共同的菌相失衡模式：具抗發炎與產丁酸（butyrate）功能的菌屬減少，促發炎相關菌屬增加。然而，以修剪填補法（trim-and-fill）校正發表偏誤後，多樣性降低的統計顯著性減弱，顯示結論需審慎解讀。這是首篇橫跨多種睡眠疾患的腸腦軸（gut-brain axis）整合分析。
多項近期研究顯示，人體腸道菌相（gut microbiome）與憂鬱、焦慮等情緒障礙之間存在顯著關聯。刊登於 NIH/PMC 神經科學與精神健康期刊的研究指出，憂鬱症患者的腸道菌多樣性較低，焦慮者則常見促發炎菌屬增加；益生菌與飲食介入在少數小規模研究的特定受試者身上展現出與藥物治療相近的症狀緩解效果，惟研究樣本數小、設計差異大，不宜直接類推。《Nature》評論進一步介紹「心理益生菌（psychobiotics）」的概念，指出恢復腸道菌相平衡可能是輔助治療方向之一。以泡菜、味噌為代表的發酵蔬菜，亦有初步證據支持其作為心理益生菌食物來源的潛力，但現有研究多為觀察性或短期介入，因果關係尚待確認。
